Генетические особенности кур по однонуклеотидным заменам в гене LCORL
Генетические особенности кур по однонуклеотидным заменам в гене LCORL
С развитием методов молекулярной генетики в последние десятилетия идет активное изучение геномов сельскохозяйственных животных и птиц. Домашняя курица (Gallus gallus domesticus) служит удобным модельным объектом для этих целей благодаря быстрому развитию и росту, возможности получения большого количества потомства от родительской пары, а также высокому генетическому разнообразию пород. Разведение кур в рамках генетических коллекций дает возможность исследователям собирать ценный фенотипический материал о малочисленных породах.
Маркерами генетической изменчивости у кур служат однонуклеотидные полиморфизмы (SNP). Они встречаются в геноме с высокой частотой. Поиск и описание подобных маркеров позволяют выявлять ассоциации с ними фенотипических признаков, что в дальнейшем может стать инструментом отбора ценных производителей для селекции.
В исследованиях геномов курицы на хромосоме 4 был выявлен регион, значимо ассоциированный с рядом фенотипических признаков. Этот участок включает ген LCORL (Ligand dependent nuclear receptor corepressor-like), который кодирует фактор транскрипции. LCORL представляет собой высоконсервативный гидрофильный белок, содержащий HTH-домен, не принадлежит к трансмембранным или секретируемым белкам. Активно экспрессируется в органах и тканях во время роста и развития птиц. Его значимая роль в метаболических процессах организма обусловлена тем, что он способен вступать во взаимодействие с убиквитином C, а также связан с метаболизмом аргинина.
В области генома, близкой к этому региону, были идентифицированы SNP, ассоциированные с массой внутренних органов цыплят, массой яйца, размером яйцевода, живой массой и промерами тела. Ген LCORL был определен как значимый ген-кандидат, ассоциированный с размерами скелета и весовыми характеристиками особей и у других видов продуктивных животных, в том числе несущих в своем геноме ген карликовости.
Анализ полиморфных вариантов в гене LCORL методом секвенирования по Сенгеру выявил изменчивость по ряду полиморфных вариантов в интроне изучаемого участка гена. Были изучены четыре породы различного типа продуктивности (корниш, китайская шелковая, итальянская куропатчатая, пушкинская). Это позволило считать район гена LCORL высоковариабельным у исследуемых популяций кур. Позднее были подобраны и апробированы четыре тест-системы по заменам rs14491003, 236 G/Т, 82 G/C, 503A/G в локусе LCORL. При этом для кур комбинированного направления продуктивности значимым определен только SNP 503A/G.
Декоративные породы являются прекрасным контрастным фоном для продуктивных пород, так как к ним не применялись селекционные программы по продуктивным признакам (мясности, яйценоскости, качеству мяса и яйца) и основной целью отбора были именно декоративные признаки, в том числе миниатюрность. В рамках изучения гена LCORL особенно важен последний показатель (миниатюрность), поскольку, с одной стороны, существует давление гена карликовости dw, а с другой — формы карликовых птиц часто повторяют форму крупных. Таким образом, научный и практический интерес представляет выявление особенностей полиморфизма гена LCORL у декоративных кур.
Новопавловская золотистая порода кур утверждена в 2016 году после продолжительной работы по воссозданию старой русской павловской породы. Благодаря сложновоспроизводительному скрещиванию создана птица, фенотипически близкая к прототипу. На первоначальном этапе скрещивали представителей пород фавероль и гудан. Затем полученные гибриды последовательно скрещивали с падуанами, аппенцеллерами и шелковой породой. Средняя живая масса по стандарту породы кур 1,5–1,8 кг, петухов 1,7–2,1 кг.
Полный текст, график по ссылке:
https://agrarnayanauka.ru/geneticheskie-osobennosti-dekorativnyh-porod-kur-po-odnonukleotidnym-zamenam-v-gene-lcorl/
Маркерами генетической изменчивости у кур служат однонуклеотидные полиморфизмы (SNP). Они встречаются в геноме с высокой частотой. Поиск и описание подобных маркеров позволяют выявлять ассоциации с ними фенотипических признаков, что в дальнейшем может стать инструментом отбора ценных производителей для селекции.
В исследованиях геномов курицы на хромосоме 4 был выявлен регион, значимо ассоциированный с рядом фенотипических признаков. Этот участок включает ген LCORL (Ligand dependent nuclear receptor corepressor-like), который кодирует фактор транскрипции. LCORL представляет собой высоконсервативный гидрофильный белок, содержащий HTH-домен, не принадлежит к трансмембранным или секретируемым белкам. Активно экспрессируется в органах и тканях во время роста и развития птиц. Его значимая роль в метаболических процессах организма обусловлена тем, что он способен вступать во взаимодействие с убиквитином C, а также связан с метаболизмом аргинина.
В области генома, близкой к этому региону, были идентифицированы SNP, ассоциированные с массой внутренних органов цыплят, массой яйца, размером яйцевода, живой массой и промерами тела. Ген LCORL был определен как значимый ген-кандидат, ассоциированный с размерами скелета и весовыми характеристиками особей и у других видов продуктивных животных, в том числе несущих в своем геноме ген карликовости.
Анализ полиморфных вариантов в гене LCORL методом секвенирования по Сенгеру выявил изменчивость по ряду полиморфных вариантов в интроне изучаемого участка гена. Были изучены четыре породы различного типа продуктивности (корниш, китайская шелковая, итальянская куропатчатая, пушкинская). Это позволило считать район гена LCORL высоковариабельным у исследуемых популяций кур. Позднее были подобраны и апробированы четыре тест-системы по заменам rs14491003, 236 G/Т, 82 G/C, 503A/G в локусе LCORL. При этом для кур комбинированного направления продуктивности значимым определен только SNP 503A/G.
Декоративные породы являются прекрасным контрастным фоном для продуктивных пород, так как к ним не применялись селекционные программы по продуктивным признакам (мясности, яйценоскости, качеству мяса и яйца) и основной целью отбора были именно декоративные признаки, в том числе миниатюрность. В рамках изучения гена LCORL особенно важен последний показатель (миниатюрность), поскольку, с одной стороны, существует давление гена карликовости dw, а с другой — формы карликовых птиц часто повторяют форму крупных. Таким образом, научный и практический интерес представляет выявление особенностей полиморфизма гена LCORL у декоративных кур.
Новопавловская золотистая порода кур утверждена в 2016 году после продолжительной работы по воссозданию старой русской павловской породы. Благодаря сложновоспроизводительному скрещиванию создана птица, фенотипически близкая к прототипу. На первоначальном этапе скрещивали представителей пород фавероль и гудан. Затем полученные гибриды последовательно скрещивали с падуанами, аппенцеллерами и шелковой породой. Средняя живая масса по стандарту породы кур 1,5–1,8 кг, петухов 1,7–2,1 кг.
Полный текст, график по ссылке:
https://agrarnayanauka.ru/geneticheskie-osobennosti-dekorativnyh-porod-kur-po-odnonukleotidnym-zamenam-v-gene-lcorl/
Источник: https://agrarnayanauka.ru
