Органические бройлерные цыплята: как возраст, условия содержания и доступ на выгул влияют на микробиом кишечника
Органические бройлерные цыплята: как возраст, условия содержания и доступ на выгул влияют на микробиом кишечника
Свободное содержание, выгул оказывает большее влияние на здоровье кишечника органических бройлерных цыплят, чем считалось ранее.
Исследователи из Университета Хоэнхайм также показали, что возраст, тип откорма и условия содержания значительно изменяют состав микробиома. Результаты дают новое понимание здоровья животных, кормления и управления птичниками в органическом земледелии.
Исследователи изучают кишечную флору органических бройлерных цыплят
Профессор Амелия Камаринья-Сильва из Департамента микробной экологии сельскохозяйственных животных Университета Хоэнхайм исследовала взаимосвязь между условиями содержания и микробиомом кишечника органических бройлерных цыплят в рамках проекта ProBioChicken и поделилась своими выводами на мероприятии сети Focus Animal Welfare Network.
Исследование основано на образцах с 14 органических ферм, где выращивались три разных типа кур-несушек: гибриды бройлеров, петухи двойного назначения и самцы-несушки. Образцы отбирались в несколько временных точек, начиная с момента вылупления и до конца периода откорма. Анализ проводился с использованием экстракции ДНК, ПЦР, секвенирования и биоинформатической оценки.
Ключевым результатом является возрастное развитие микробиома кишечника. Разнообразие бактериальных сообществ, измеренное с помощью индекса Шеннона, было самым низким в меконии сразу после вылупления и впоследствии значительно увеличивалось. Наблюдались различия между типами откорма: в то время как разнообразие непрерывно увеличивалось у гибридов бройлеров, у петухов двойного назначения наблюдалось заметное увеличение после выпуска на открытый выгул. У самцов-несушек микробиом стабилизировался на ранних стадиях и позже практически не реагировал на доступ на открытый воздух.
От ранних колонизаторов к стабильной кишечной экосистеме
Состав микробиома коренным образом менялся в процессе выращивания. Сразу после вылупления преобладали Enterococcus и Escherichia-Shigella, в то время как виды Clostridium в значительной степени исчезали через короткое время. На раннюю колонизацию в основном влияли условия инкубации, вылупление и транспортировка. С возрастом развивался более сложный и стабильный микробиом, характеризующийся молочнокислыми бактериями, такими как Lactobacillus, Ligilactobacillus и Limosilactobacillus. Эти группы поддерживают иммунную функцию, укрепляют кишечный барьер и препятствуют колонизации патогенов. Их дополняют Bifidobacterium, важный представитель здоровой кишечной флоры, и Bacteroides, продуцирующие короткоцепочечные жирные кислоты. Enterococcus и Escherichia-Shigella оставались обнаруживаемыми в составе основного микробиома на протяжении всего периода выращивания.
Доступ к открытому воздуху приносит разнообразие – но и новые риски
Доступ к открытому воздуху влиял на кишечную микробиоту у всех типов откорма. После начала доступа на открытый воздух увеличилась частота встречаемости связанных с окружающей средой и клетчаткой бактериальных групп, таких как Prevotellaceae UCG-001 и Rikenellaceae RC9. Это указывает на более частый контакт с растительным материалом и микроорганизмами окружающей среды. В то же время уменьшилась частота встречаемости некоторых связанных с птичником бактериальных групп. Однако в некоторых случаях чаще обнаруживались и условно-патогенные бактерии (бактерии, размножающиеся при ослаблении иммунной системы), такие как Gallibacterium. Результаты показывают, что доступ на открытый воздух увеличивает микробное разнообразие, но также создает новые риски заражения.
Различия между типами откорма
Все исследованные типы откорма продемонстрировали в целом стабильную кишечную микробиоту, в которой преобладали пробиотические бактерии. Кроме того, наблюдались специфические для каждого типа откорма корреляции между микробиомом и состоянием здоровья.
У гибридов бройлеров снижение количества Lawsonia было связано с ухудшением состояния здоровья. У петухов двойного назначения Olsenella оказалась возможным индикатором хорошего благополучия. У самцов кур-несушек повышенное содержание определенных бактерий окружающей среды может указывать на снижение колонизационной резистентности. Однако единых биомаркеров благополучия животных выявить не удалось.
Анализ микробиома может помочь фермам в будущем.
Хотя условия содержания в инкубаторе, транспортировка, подстилка и условия прибытия значительно влияют на первоначальный микробиом, доступ на открытый воздух может способствовать развитию полезных бактерий, но требует тщательного контроля растительности, влажных зон и потенциального загрязнения дикими птицами.
Результаты также подтверждают подходы к управлению, специфичные для каждого типа бройлеров: в то время как микробиом самцов кур-несушек стабилизируется на ранних стадиях, у бройлерных кур он остается в стадии развития в течение более длительного периода.
В долгосрочной перспективе анализ микробиома может использоваться в качестве инструмента мониторинга и сравнительной оценки. Однако его значимость раскрывается только в сочетании с данными о здоровье и состоянии фермы.
Автор: Magdalena Esterer

Исследователи из Университета Хоэнхайм также показали, что возраст, тип откорма и условия содержания значительно изменяют состав микробиома. Результаты дают новое понимание здоровья животных, кормления и управления птичниками в органическом земледелии.
Исследователи изучают кишечную флору органических бройлерных цыплят
Профессор Амелия Камаринья-Сильва из Департамента микробной экологии сельскохозяйственных животных Университета Хоэнхайм исследовала взаимосвязь между условиями содержания и микробиомом кишечника органических бройлерных цыплят в рамках проекта ProBioChicken и поделилась своими выводами на мероприятии сети Focus Animal Welfare Network.
Исследование основано на образцах с 14 органических ферм, где выращивались три разных типа кур-несушек: гибриды бройлеров, петухи двойного назначения и самцы-несушки. Образцы отбирались в несколько временных точек, начиная с момента вылупления и до конца периода откорма. Анализ проводился с использованием экстракции ДНК, ПЦР, секвенирования и биоинформатической оценки.
Ключевым результатом является возрастное развитие микробиома кишечника. Разнообразие бактериальных сообществ, измеренное с помощью индекса Шеннона, было самым низким в меконии сразу после вылупления и впоследствии значительно увеличивалось. Наблюдались различия между типами откорма: в то время как разнообразие непрерывно увеличивалось у гибридов бройлеров, у петухов двойного назначения наблюдалось заметное увеличение после выпуска на открытый выгул. У самцов-несушек микробиом стабилизировался на ранних стадиях и позже практически не реагировал на доступ на открытый воздух.
От ранних колонизаторов к стабильной кишечной экосистеме
Состав микробиома коренным образом менялся в процессе выращивания. Сразу после вылупления преобладали Enterococcus и Escherichia-Shigella, в то время как виды Clostridium в значительной степени исчезали через короткое время. На раннюю колонизацию в основном влияли условия инкубации, вылупление и транспортировка. С возрастом развивался более сложный и стабильный микробиом, характеризующийся молочнокислыми бактериями, такими как Lactobacillus, Ligilactobacillus и Limosilactobacillus. Эти группы поддерживают иммунную функцию, укрепляют кишечный барьер и препятствуют колонизации патогенов. Их дополняют Bifidobacterium, важный представитель здоровой кишечной флоры, и Bacteroides, продуцирующие короткоцепочечные жирные кислоты. Enterococcus и Escherichia-Shigella оставались обнаруживаемыми в составе основного микробиома на протяжении всего периода выращивания.
Доступ к открытому воздуху приносит разнообразие – но и новые риски
Доступ к открытому воздуху влиял на кишечную микробиоту у всех типов откорма. После начала доступа на открытый воздух увеличилась частота встречаемости связанных с окружающей средой и клетчаткой бактериальных групп, таких как Prevotellaceae UCG-001 и Rikenellaceae RC9. Это указывает на более частый контакт с растительным материалом и микроорганизмами окружающей среды. В то же время уменьшилась частота встречаемости некоторых связанных с птичником бактериальных групп. Однако в некоторых случаях чаще обнаруживались и условно-патогенные бактерии (бактерии, размножающиеся при ослаблении иммунной системы), такие как Gallibacterium. Результаты показывают, что доступ на открытый воздух увеличивает микробное разнообразие, но также создает новые риски заражения.
Различия между типами откорма
Все исследованные типы откорма продемонстрировали в целом стабильную кишечную микробиоту, в которой преобладали пробиотические бактерии. Кроме того, наблюдались специфические для каждого типа откорма корреляции между микробиомом и состоянием здоровья.
У гибридов бройлеров снижение количества Lawsonia было связано с ухудшением состояния здоровья. У петухов двойного назначения Olsenella оказалась возможным индикатором хорошего благополучия. У самцов кур-несушек повышенное содержание определенных бактерий окружающей среды может указывать на снижение колонизационной резистентности. Однако единых биомаркеров благополучия животных выявить не удалось.
Анализ микробиома может помочь фермам в будущем.
Хотя условия содержания в инкубаторе, транспортировка, подстилка и условия прибытия значительно влияют на первоначальный микробиом, доступ на открытый воздух может способствовать развитию полезных бактерий, но требует тщательного контроля растительности, влажных зон и потенциального загрязнения дикими птицами.
Результаты также подтверждают подходы к управлению, специфичные для каждого типа бройлеров: в то время как микробиом самцов кур-несушек стабилизируется на ранних стадиях, у бройлерных кур он остается в стадии развития в течение более длительного периода.
В долгосрочной перспективе анализ микробиома может использоваться в качестве инструмента мониторинга и сравнительной оценки. Однако его значимость раскрывается только в сочетании с данными о здоровье и состоянии фермы.
Автор: Magdalena Esterer

Источник: https://www.gefluegelnews.de
